Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PATE4P0C8F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATE4P0C8F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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