Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA1P09110 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACAA1P09110 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACAA1P09110 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAA1P09110 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms