Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB1P08034 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB1P08034 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB1P08034 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB1P08034 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB1P08034 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB1P08034 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB1P08034 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB1P08034 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB1P08034 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB1P08034 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB1P08034 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB1P08034 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB1P08034 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB1P08034 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB1P08034 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB1P08034 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB1P08034 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB1P08034 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB1P08034 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB1P08034 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB1P08034 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB1P08034 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB1P08034 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB1P08034 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB1P08034 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB1P08034 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB1P08034 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB1P08034 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB1P08034 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB1P08034 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB1P08034 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB1P08034 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB1P08034 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB1P08034 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB1P08034 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB1P08034 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB1P08034 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB1P08034 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB1P08034 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB1P08034 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB1P08034 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB1P08034 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB1P08034 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB1P08034 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB1P08034 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB1P08034 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB1P08034 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB1P08034 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB1P08034 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB1P08034 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB1P08034 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB1P08034 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB1P08034 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB1P08034 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB1P08034 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB1P08034 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB1P08034 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB1P08034 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GJB1P08034 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms