Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPBP07199 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPBP07199 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPBP07199 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CENPBP07199 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CENPBP07199 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CENPBP07199 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CENPBP07199 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPBP07199 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPBP07199 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPBP07199 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPBP07199 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CENPBP07199 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPBP07199 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPBP07199 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPBP07199 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPBP07199 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPBP07199 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPBP07199 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPBP07199 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPBP07199 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPBP07199 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CENPBP07199 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPBP07199 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPBP07199 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPBP07199 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPBP07199 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPBP07199 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPBP07199 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPBP07199 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPBP07199 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPBP07199 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPBP07199 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPBP07199 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPBP07199 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPBP07199 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPBP07199 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPBP07199 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPBP07199 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPBP07199 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPBP07199 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPBP07199 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPBP07199 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPBP07199 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPBP07199 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPBP07199 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CENPBP07199 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPBP07199 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CENPBP07199 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CENPBP07199 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CENPBP07199 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPBP07199 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPBP07199 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPBP07199 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPBP07199 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CENPBP07199 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPBP07199 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPBP07199 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CENPBP07199 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CENPBP07199 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CENPBP07199 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CENPBP07199 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CENPBP07199 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CENPBP07199 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPBP07199 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPBP07199 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPBP07199 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPBP07199 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPBP07199 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPBP07199 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPBP07199 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPBP07199 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPBP07199 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPBP07199 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPBP07199 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms