Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYPBP06028 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYPBP06028 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYPBP06028 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYPBP06028 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYPBP06028 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYPBP06028 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYPBP06028 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYPBP06028 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYPBP06028 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYPBP06028 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GYPBP06028 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GYPBP06028 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYPBP06028 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYPBP06028 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYPBP06028 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYPBP06028 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYPBP06028 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYPBP06028 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GYPBP06028 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYPBP06028 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYPBP06028 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GYPBP06028 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYPBP06028 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYPBP06028 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYPBP06028 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GYPBP06028 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GYPBP06028 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYPBP06028 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYPBP06028 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYPBP06028 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYPBP06028 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYPBP06028 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GYPBP06028 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYPBP06028 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYPBP06028 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYPBP06028 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYPBP06028 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYPBP06028 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYPBP06028 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GYPBP06028 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYPBP06028 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYPBP06028 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYPBP06028 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYPBP06028 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYPBP06028 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYPBP06028 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYPBP06028 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYPBP06028 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYPBP06028 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYPBP06028 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYPBP06028 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYPBP06028 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYPBP06028 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYPBP06028 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYPBP06028 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYPBP06028 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPBP06028 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPBP06028 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms