Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFAP2AP05549 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFAP2AP05549 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAP2AP05549 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms