Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1B1P05026 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms