Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THY1P04216 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THY1P04216 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THY1P04216 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THY1P04216 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THY1P04216 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THY1P04216 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THY1P04216 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THY1P04216 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THY1P04216 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THY1P04216 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THY1P04216 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THY1P04216 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THY1P04216 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THY1P04216 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THY1P04216 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THY1P04216 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THY1P04216 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THY1P04216 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THY1P04216 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THY1P04216 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THY1P04216 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THY1P04216 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THY1P04216 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THY1P04216 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THY1P04216 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THY1P04216 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THY1P04216 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THY1P04216 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THY1P04216 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THY1P04216 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THY1P04216 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THY1P04216 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THY1P04216 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THY1P04216 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THY1P04216 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THY1P04216 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
THY1P04216 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THY1P04216 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THY1P04216 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THY1P04216 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THY1P04216 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THY1P04216 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THY1P04216 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THY1P04216 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THY1P04216 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THY1P04216 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THY1P04216 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THY1P04216 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THY1P04216 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THY1P04216 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THY1P04216 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THY1P04216 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THY1P04216 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THY1P04216 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms