Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC3P02656 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC3P02656 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC3P02656 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC3P02656 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC3P02656 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC3P02656 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC3P02656 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC3P02656 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC3P02656 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC3P02656 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC3P02656 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC3P02656 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC3P02656 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC3P02656 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC3P02656 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC3P02656 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC3P02656 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC3P02656 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC3P02656 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC3P02656 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC3P02656 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC3P02656 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC3P02656 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC3P02656 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC3P02656 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC3P02656 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC3P02656 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC3P02656 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC3P02656 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC3P02656 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC3P02656 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC3P02656 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC3P02656 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC3P02656 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC3P02656 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC3P02656 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC3P02656 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC3P02656 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC3P02656 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms