Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DRAP01903 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HLA-DRAP01903 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DRAP01903 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DRAP01903 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DRAP01903 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DRAP01903 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms