Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCAP01258 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCAP01258 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCAP01258 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCAP01258 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCAP01258 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCAP01258 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCAP01258 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCAP01258 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCAP01258 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCAP01258 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCAP01258 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCAP01258 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCAP01258 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCAP01258 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCAP01258 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCAP01258 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCAP01258 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCAP01258 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALCAP01258 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALCAP01258 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALCAP01258 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALCAP01258 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCAP01258 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCAP01258 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCAP01258 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCAP01258 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCAP01258 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCAP01258 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCAP01258 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCAP01258 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCAP01258 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCAP01258 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCAP01258 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCAP01258 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALCAP01258 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALCAP01258 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALCAP01258 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALCAP01258 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCAP01258 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCAP01258 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCAP01258 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCAP01258 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCAP01258 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCAP01258 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCAP01258 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCAP01258 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCAP01258 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCAP01258 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCAP01258 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCAP01258 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCAP01258 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCAP01258 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CALCAP01258 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCAP01258 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALCAP01258 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CALCAP01258 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCAP01258 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms