Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH8O95206 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH8O95206 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH8O95206 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH8O95206 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms