Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCBTB2O95199 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCBTB2O95199 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCBTB2O95199 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCBTB2O95199 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms