Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT1O95170 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT1O95170 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT1O95170 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms