Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM13AO94988 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM13AO94988 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM13AO94988 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM13AO94988 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM13AO94988 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM13AO94988 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM13AO94988 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM13AO94988 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM13AO94988 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM13AO94988 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM13AO94988 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM13AO94988 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM13AO94988 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM13AO94988 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM13AO94988 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM13AO94988 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM13AO94988 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM13AO94988 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.51■■■□□ 2
FAM13AO94988 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FAM13AO94988 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM13AO94988 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms