Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN7O94888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN7O94888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN7O94888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms