Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPXO76031 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPXO76031 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPXO76031 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPXO76031 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPXO76031 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPXO76031 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPXO76031 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPXO76031 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPXO76031 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPXO76031 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPXO76031 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPXO76031 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPXO76031 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPXO76031 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPXO76031 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPXO76031 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPXO76031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPXO76031 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPXO76031 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPXO76031 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPXO76031 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPXO76031 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPXO76031 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPXO76031 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPXO76031 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPXO76031 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPXO76031 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPXO76031 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPXO76031 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPXO76031 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPXO76031 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPXO76031 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPXO76031 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPXO76031 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPXO76031 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPXO76031 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPXO76031 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPXO76031 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPXO76031 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms