Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OFD1O75665 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OFD1O75665 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
OFD1O75665 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OFD1O75665 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OFD1O75665 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
OFD1O75665 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OFD1O75665 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OFD1O75665 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OFD1O75665 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OFD1O75665 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OFD1O75665 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OFD1O75665 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OFD1O75665 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OFD1O75665 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OFD1O75665 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OFD1O75665 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OFD1O75665 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OFD1O75665 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OFD1O75665 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OFD1O75665 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OFD1O75665 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
OFD1O75665 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OFD1O75665 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OFD1O75665 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OFD1O75665 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OFD1O75665 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OFD1O75665 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OFD1O75665 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OFD1O75665 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OFD1O75665 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OFD1O75665 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OFD1O75665 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OFD1O75665 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OFD1O75665 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OFD1O75665 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OFD1O75665 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OFD1O75665 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OFD1O75665 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OFD1O75665 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OFD1O75665 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OFD1O75665 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OFD1O75665 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OFD1O75665 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OFD1O75665 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OFD1O75665 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OFD1O75665 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OFD1O75665 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OFD1O75665 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OFD1O75665 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OFD1O75665 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OFD1O75665 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OFD1O75665 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OFD1O75665 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OFD1O75665 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OFD1O75665 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OFD1O75665 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OFD1O75665 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OFD1O75665 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OFD1O75665 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OFD1O75665 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OFD1O75665 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OFD1O75665 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OFD1O75665 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms