Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF21O75509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF21O75509 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF21O75509 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF21O75509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms