Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMDSO60547 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMDSO60547 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMDSO60547 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMDSO60547 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMDSO60547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMDSO60547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMDSO60547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMDSO60547 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GMDSO60547 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GMDSO60547 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMDSO60547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMDSO60547 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GMDSO60547 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMDSO60547 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMDSO60547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMDSO60547 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMDSO60547 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMDSO60547 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMDSO60547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMDSO60547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GMDSO60547 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMDSO60547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMDSO60547 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMDSO60547 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMDSO60547 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMDSO60547 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMDSO60547 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GMDSO60547 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GMDSO60547 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMDSO60547 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMDSO60547 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMDSO60547 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMDSO60547 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMDSO60547 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GMDSO60547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMDSO60547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMDSO60547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMDSO60547 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMDSO60547 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GMDSO60547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMDSO60547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMDSO60547 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GMDSO60547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMDSO60547 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMDSO60547 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMDSO60547 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMDSO60547 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMDSO60547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMDSO60547 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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