Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B3O60423 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B3O60423 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B3O60423 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms