Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF1CO43896 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIF1CO43896 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF1CO43896 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms