Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN4O43707 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN4O43707 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN4O43707 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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