Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCK2O43639 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCK2O43639 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCK2O43639 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCK2O43639 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCK2O43639 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCK2O43639 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCK2O43639 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCK2O43639 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCK2O43639 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCK2O43639 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCK2O43639 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCK2O43639 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCK2O43639 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCK2O43639 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCK2O43639 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCK2O43639 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCK2O43639 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCK2O43639 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCK2O43639 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCK2O43639 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCK2O43639 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NCK2O43639 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCK2O43639 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCK2O43639 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCK2O43639 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCK2O43639 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCK2O43639 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCK2O43639 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCK2O43639 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NCK2O43639 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCK2O43639 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCK2O43639 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NCK2O43639 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCK2O43639 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCK2O43639 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NCK2O43639 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCK2O43639 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCK2O43639 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCK2O43639 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCK2O43639 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCK2O43639 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCK2O43639 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCK2O43639 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCK2O43639 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCK2O43639 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NCK2O43639 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCK2O43639 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCK2O43639 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCK2O43639 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCK2O43639 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCK2O43639 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCK2O43639 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCK2O43639 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCK2O43639 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCK2O43639 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCK2O43639 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCK2O43639 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms