Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD51CO43502 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51CO43502 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD51CO43502 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51CO43502 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms