Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA2O43364 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA2O43364 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA2O43364 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms