Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK1O15075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK1O15075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK1O15075 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLK1O15075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLK1O15075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms