Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAMP3O14828 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP3O14828 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP3O14828 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms