Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1O14717 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1O14717 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1O14717 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1O14717 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms