Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA4O00629 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA4O00629 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA4O00629 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA4O00629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms