Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGRPO00253 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGRPO00253 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGRPO00253 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGRPO00253 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGRPO00253 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGRPO00253 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGRPO00253 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGRPO00253 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGRPO00253 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGRPO00253 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGRPO00253 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGRPO00253 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGRPO00253 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGRPO00253 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGRPO00253 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGRPO00253 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGRPO00253 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGRPO00253 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGRPO00253 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGRPO00253 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGRPO00253 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGRPO00253 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGRPO00253 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
AGRPO00253 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGRPO00253 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGRPO00253 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGRPO00253 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGRPO00253 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGRPO00253 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGRPO00253 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGRPO00253 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGRPO00253 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGRPO00253 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGRPO00253 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGRPO00253 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGRPO00253 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGRPO00253 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGRPO00253 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGRPO00253 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGRPO00253 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGRPO00253 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGRPO00253 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGRPO00253 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGRPO00253 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGRPO00253 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGRPO00253 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGRPO00253 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGRPO00253 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms