Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN8O00124 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN8O00124 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN8O00124 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN8O00124 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN8O00124 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN8O00124 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN8O00124 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN8O00124 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms