Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
E9PCH4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
E9PCH4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
E9PCH4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
E9PCH4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
E9PCH4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
E9PCH4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
E9PCH4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
E9PCH4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
E9PCH4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
E9PCH4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
E9PCH4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
E9PCH4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
E9PCH4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
E9PCH4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
E9PCH4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
E9PCH4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
E9PCH4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
E9PCH4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
E9PCH4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
E9PCH4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
E9PCH4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
E9PCH4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
E9PCH4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
E9PCH4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
E9PCH4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
E9PCH4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
E9PCH4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
E9PCH4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
E9PCH4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
E9PCH4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
E9PCH4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
E9PCH4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
E9PCH4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
E9PCH4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
E9PCH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
E9PCH4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
E9PCH4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
E9PCH4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
E9PCH4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
E9PCH4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
E9PCH4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
E9PCH4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
E9PCH4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
E9PCH4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
E9PCH4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
E9PCH4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
E9PCH4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
E9PCH4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
E9PCH4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
E9PCH4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
E9PCH4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
E9PCH4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
E9PCH4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
E9PCH4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
E9PCH4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
E9PCH4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
E9PCH4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
E9PCH4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
E9PCH4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
E9PCH4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
E9PCH4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
E9PCH4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
E9PCH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
E9PCH4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
E9PCH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
E9PCH4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
E9PCH4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
E9PCH4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
E9PCH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
E9PCH4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
E9PCH4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
E9PCH4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
E9PCH4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
E9PCH4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
E9PCH4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
E9PCH4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
E9PCH4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
E9PCH4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
E9PCH4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
E9PCH4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
E9PCH4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
E9PCH4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
E9PCH4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
E9PCH4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms