Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4E171 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4E171 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4E171 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4E171 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4E171 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4E171 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4E171 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
B4E171 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4E171 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4E171 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4E171 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4E171 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4E171 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4E171 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4E171 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4E171 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4E171 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4E171 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4E171 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4E171 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4E171 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4E171 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4E171 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4E171 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4E171 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
B4E171 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4E171 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4E171 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4E171 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4E171 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4E171 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
B4E171 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4E171 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4E171 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4E171 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4E171 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4E171 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4E171 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4E171 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4E171 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4E171 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4E171 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4E171 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4E171 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4E171 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4E171 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4E171 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
B4E171 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4E171 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms