Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM229AB2RXF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM229AB2RXF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM229AB2RXF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms