Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSTM5A8MXK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM5A8MXK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM5A8MXK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM5A8MXK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms