Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MVJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MVJ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MVJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MVJ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MVJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MVJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A8MVJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A8MVJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A8MVJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MVJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MVJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MVJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MVJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MVJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MVJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MVJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MVJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A8MVJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A8MVJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A8MVJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A8MVJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A8MVJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A8MVJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MVJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MVJ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MVJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MVJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A8MVJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A8MVJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A8MVJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MVJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MVJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MVJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MVJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MVJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MVJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MVJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MVJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MVJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MVJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MVJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MVJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MVJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A8MVJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MVJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MVJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MVJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MVJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MVJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MVJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MVJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms