Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIIAD1A6NNX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIIAD1A6NNX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIIAD1A6NNX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms