Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TVP23AA6NH52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23AA6NH52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TVP23AA6NH52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms