Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC13A5PLN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC13A5PLN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms