Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM89A2RUT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM89A2RUT3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms