Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBASA2RRP1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBASA2RRP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBASA2RRP1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms