Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM129A0AVI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM129A0AVI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM129A0AVI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms