Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SERP1Q9Y6X1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms