Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms