Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms