Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms