Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX4Q9Y2E6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms