Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms