Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms